Ученые БГМУ Минздрава России первыми в стране подготовили и отсеквенировали библиотеки единичных клеток при раке простаты. Ранее исследования в России проводились на образцах опухолевой ткани легкого, молочной железы, при саркомах и других видах злокачественных новообразований.
Библиотека единичных клеток представляет собой набор фрагментов нуклеиновых кислот, выделенных из одной клетки. Фрагменты ДНК маркируются уникальным штрих-кодом (специфичным адаптером), который в дальнейшем позволяет определить какой фрагмент принадлежит той или иной клетке. Для секвенирования требуются библиотеки с фрагментами определенной длины, которые будут «прочитаны» секвенатором. Далее следуют этап биоинформатической обработки, после чего ученые получают огромный массив данных секвенирования и могут расшифровать молекулярный «портрет» каждой клетки в отдельности.
Технология секвенирования отдельных клеток состоит из четырех основных этапов:
· выделения одиночных клеток из клеточной популяции;
· выделения РНК из каждой изолированной клетки и перевода ее в кодирующую ДНК;
· подготовки библиотеки для секвенирования с использованием изолированного материала;
· секвенирования транскриптома отдельных клеток.
Каждая клетка в ткани или органе может по-разному влиять на развитие патологии или реагировать на терапию. Секвенирование отдельных клеток помогает оценить их индивидуальный вклад в конкретный процесс. Подобный уровень детализации особенно ценен при изучении редких типов клеток или же разных вариаций в популяциях одного типа клеток. Так, метод используется для изучения происхождения и развития резистентности к химиотерапии опухолевых клеток или, например, исследования неизвестных функций генов. Секвенирование единичных клеток позволяет изучать характеристики конкретной клетки с ее специфическими особенностями. Такой подход используется для оценки экспрессии определенных генов в конкретных клетках.
Работа над проектом велась в лаборатории иммунологии Института онкологии и клинической урологии Клиники БГМУ под шефством руководителя научной поддержки компании Skygen Тимура Ягудина. Исследование выполнено с использованием уникальной технологии Chromium Fixed RNA Profiling на платформе 10Х Genomix, которая открывает новые возможности для изучения сложных взаимодействий иммунного ответа и микроокружения опухоли.
Результаты секвенирования единичных клеток позволят ученым:
· идентифицировать новые терапевтические мишени (более эффективное воздействие лекарственных средств) и биомаркеры, которые помогут сделать прогноз течения заболевания;
· исследовать механизмы развития, прогрессирования и метастазирования опухоли;
· углубить понимание роли иммунной системы в борьбе с онкологическими заболеваниями.
Полученные данные могут стать основой для разработки персонализированных методов лечения рака простаты и внести значимый вклад в борьбу с онкологическими заболеваниями.
Успешно реализовывать прорывные научные исследования БГМУ Минздрава России позволяют собственная клиническая база – Клиника БГМУ, современные научные лаборатории, созданные благодаря участию вуза в федеральной программе поддержки университетов «Приоритет-2030».
СМИ о нас: https://www.bashinform.ru/news/medicine/2025-10-08/mediki-bashkirii-sovershili-proryv-v-onkologii-44...