В 1974 году окончила стоматологический факультет Казанского госмединститута и с этого года работает в Башкортостане сначала врачом стоматологом ортопедом и ортодонтом в стоматологической поликлинике № 1 г.Уфы, с 1981г. ассистентом кафедры стоматологии детского возраста, а с 1984 года - зав.кафедрой ортопедической стоматологии в Башкирском государственном медицинском университете. Работая  врачом  ортодонтом,  она обследовала детское и взрослое население  Башкортостана, выявляя большую нуждаемость  в ортодонтическом лечении. В 1981 году после очной аспирантуры на кафедре ортопедической стоматологии КГМИ (1979-1981гг) ею защищена кандидатская диссертация на тему: «Особенности диагностики и лечения аномалий прикуса у детей с нарушенным носовым дыханием». По результатам диссертационной работы изданы 2 информационных письма и 2 методические рекомендации по профилактике и лечению зубочелюстных аномалий у детей, которые используются  до настоящего времени в ортодонтических отделениях и кабинетах стоматологических учреждений  Республики детскими стоматологами и персоналом детских учреждений и родителями.

Долгие годы работая региональным представителем Башкортостана в правлении общества ортодонтов России и учитывая низкий уровень ортодонтической помощи населению Республики, Ф.Ф. Маннанова приложила большие усилия для улучшения этой помощи.   Она многократно выезжала в районы Республики и оказывала консультативно-методическую помощь на местах. По результатам анализа стоматологической службы в Республике она ежегодно выступала с докладами на научно-практических конференциях, всероссийских съездах  стоматологов, по радио и телевидению, в периодической республиканской печати, неоднократно представила материалы на коллегиях МЗ  РБ (2000, 2002гг), была инициатором выездных циклов усовершенствования, а также ежегодных  семинаров для врачей-ортодонтов по новым технологиям диагностики и лечения зубочелюстных аномалий, в т.ч. эджуайс-техникой.

Флора Фатыховна с 1984 года по 2003 год была методическим руководителем интернатуры БГМУ по стоматологии. До настоящего времени она много времени уделяет последипломной подготовке специалистов: несколько лет работала в составе лицензионно - аккредитационной, сертификационной комиссий МЗ РБ. Долгие годы работала председателем профильной аттестационной комиссии МЗ РБ по стоматологии, а теперь зам. председателя. Работала на курсах повышения квалификации зубных техников и зубных врачей, читала лекции и принимала экзамены. На кафедре подготовлены 26 клинических ординаторов, обучаются еще – 8, в т.ч. 3 иностранца. Проводилось обучение на рабочем месте новым технологиям ортопедического лечения 16 врачей и 24 зубных техника из стоматологических учреждений Республики.

Ф.Ф.Маннанова является членом жюри Федерального чемпионата по ортопедической стоматологии. Активно участвует в организации и проведении ежегодных республиканских конкурсов, научно-практических конференций и Всероссийских Симпозиумов по линии стоматологической ассоциации России.

Она бессменный член редакционной коллегии по выпуску всех сборников материалов всероссийских и республиканских конференций, прошедших в г.Уфе и других городах РБ, журналов "Проблемы стоматологии" (г.Екатеринбург) с 2005г., «Новые технологии в ортопедической стоматологии» с 2007 года (г.Москва).

Ф.Ф.Маннанова активно проводит научные исследования. В 1996 году она в Москве успешно защитила докторскую диссертацию на тему: «Ранняя диагностика, профилактика и морфофункциональная коррекция зубочелюстных аномалий и деформаций у детей при недоразвитии нижней челюсти». Ею опубликовано более 190 научных работ, в т.ч. 2 монографии, 3 учебных пособия с грифом УМО, получено 17 патентов на изобретения, 18 свидетельств на рацпредложения, изданы 22 методических рекомендаций. Ф.Ф. Маннанова соавтор 6 учебников по ортопедической стоматологии, в том числе 2 для обучения зубных техников в России. (Перечень в разделе научно методическая работа).

Под руководством Ф.Ф.Маннановой ее ученики активно занимаются научно-исследователькой работой. Сотрудниками кафедры защищены 8 кандидатских диссертаций. Под ее руководством защищены 1 докторская и 11 кандидатских диссертаций, выполняются 2 докторские и 6 кандидатских диссертаций, в т.ч. 4 соискателями из числа практических врачей.

Ф.Ф.Маннанова – врач высшей категории, владеет всеми современными сложными методами ортопедического и ортодонтического лечения. Лечебно-консультативную работу проводит на базе стоматологической поликлиники БГМУ,  где функционирует Уфимский лечебно-консультативный стоматологический центр. Ежегодно консультирует 250-300 сложных стоматологических больных, направленных практическими врачами г. Уфы и Республики.

За большие заслуги в здравоохранении Республики в 1986 году она удостоена звания «Отличника здравоохранения СССР», награждена дважды (1993,1996гг.) почетной грамотой МЗ РБ. В 1998 году ей присвоено звание "Заслуженного врача Республики Башкортостан". В 2000 году она получила медаль I степени "Отличника стоматологии" по линии стоматологической ассоциации России и в 2002 году - благодарность МЗ РФ за заслуги в области здравоохранения и многолетнюю работу.