Заведующий кафедрой, профессор, д.м.н.
Окончил БГМИ в 1986 году. С 1991 года работал в должности ассистента кафедры, а с 1999 года в должности доцента кафедры хирургии с курсом эндоскопии ИПО, в 2001 году переведен на должность профессора кафедры. С 2006 года работал директором ИПО БГМУ. С 2009 года  работал проректором по лечебной работе университета. С июня 2011 года Кунафин М.С. назначен на должность заведующего кафедрой скорой помощи и медицины катастроф с курсами термической травмы и трансфузиологии ИПО. Кандидатскую диссертацию Кунафин М.С. защитил в Харьковском медицинском институте в 1991 году, докторская диссертация защищена в БГМУ в 2000 году досрочно и в 2001 году получено утверждение ВАК.
Кунафин М.С. активно занимается научной работой. За время работы опубликовано более 370 научных и учебно-методических работ, автор 29 патентов на изобретение. В течение 6 лет дважды проводил научную работу по грантам АН РБ. Результаты работы представлены в 4 кандидатских и одной докторской диссертации, опубликованы в научных отчетах по достижениям Академии наук РБ. Научные направления - неотложная хирургия органов брюшной полости, общая хирургия, колопроктология, ангиохирургия, скорая медицинская помощь, трансфузиология, комбустиология. Является членом Проблемной комиссии по «хирургическим болезням», членом аттестационной комиссии при МЗ РБ по скорой медицинской помощи.

Заслуженный врач Республики Башкортостан. Член профильной комиссии МЗ РФ  по скорой медицинской помощи и по первой помощи, член экспертного Совета комитета по здравоохранению Государственной Думы Российской Федерации, председатель общественного Совета при Управлении Росздравнадзора России по Республике Башкортостан 2012-2019 годы. Член экспертного Совета по образованию по первой помощи в Приволжском  Федеральном округе. Председатель Башкирского отделения РООСМП. Председатель Башкирского отделения ООО по первой помощи.